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國家基因庫發起“千種魚轉錄組計劃”

更新時間:2013-11-22      瀏覽次數:1417

11月19日,深圳國家基因庫宣布“千種魚轉錄組計劃”(Fish T1K)正式啟動。該項目旨在解密魚類起源、進化、生殖、發育、性別調控和免疫等活動機制,以更好應對魚類育種、疾病防控、海洋食品安全和生物多樣性保護等帶來的諸多挑戰。項目計劃在未來3~5年內完成約1000種魚類轉錄組的測序、組裝工作,并構建高質量的魚類轉錄組數據信息平臺。

 

相對于其他魚類轉錄組研究,千種魚轉錄組計劃規模大、學科交叉廣、綜合性強,在范圍內尚屬*。

 

該項目產出的所有數據將通過國家基因庫公開,以保證科學家可以實時掌握魚類研究動態及RNA-seq測序技術的應用。

 

據介紹,到目前為止,僅有約10種魚類的基因組被公開報道。此外,在NCBI公共數據庫中僅有80多種魚類轉錄組數據。

 

國家基因庫海洋分庫負責人、該項目帶頭人孫穎認為:“T1K項目將建立*專門針對魚類組學研究的性合作網絡,并將大大深化我們對魚類的比較生理學、生物地理學認識,促進魚類資源醫用價值的挖掘、經濟和生態價值的開發,以及生物多樣性保護等問題的解決。”

 

《中國科學報》 (2013-11-21 第1版 要聞)

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